Graduado na Sorbonne, Bernard Margueritte ingressou no Le Monde em 1965 e foi seu correspondente para a Europa Oriental em Varsóvia de 1966 a 1970. Expulso da Polônia em 1971, mudou-se para Viena. De 1975 a 1977 foi pesquisador da Universidade de Harvard. Ele retornou a Varsóvia em 1977 como correspondente de jornais e rádio franceses. Ele esteve novamente em Harvard de 1993 a 1994 como Visiting Fellow no Centro de Pesquisa Russo e no Centro de Imprensa e Política. É colaborador frequente da televisão e dos jornais polacos.
Seus artigos foram publicados no Le Monde, Le Figaro e Politique Etrangere. Ele é coautor de livros sobre a Áustria e a Planificação na Europa Oriental e autor de um artigo de pesquisa The New Central Europe: the hard birth of a free press, publicado pela Harvard University (1995).
Bernard Margueritte tornou-se vice-presidente do Fórum Internacional de Comunicações em 1996 e presidente em 2001.